Bækkenområdet har store organer under dets lag af muskler. Nogle af de vigtigste inkluderer de største fordøjelsesorganer, tarmene.
Tyndtarmen er den længste del af fordøjelseskanalen. Den modtager mad fra maven og begynder at nedbryde maden, mens den absorberer størstedelen af dens næringsstoffer. Slimet, som dette lange hule organ udskiller, nedbryder proteiner og kulhydrater og beskytter tyndtarmen mod skadelige maveenzymer, proteiner, der øger hastigheden af kemiske reaktioner. Enzymer udskilt af leveren og bugspytkirtlen hjælper yderligere fordøjelsen.
Tyndtarmen er længere af de to, så tyktarmen fik sit navn, fordi den er meget bredere i diameter.
Tyktarmen forbinder med tyndtarmen i den nedre højre del af bughulen. En muskuløs lukkemuskel (ringlignende struktur), ileocecal, forhindrer mad i at rejse tilbage op i tyndtarmen.
Tyktarmen er fyldt med millioner af bakterier, der gør mad til fast afføring og fjerner vand og elektrolytter. Når mad bevæger sig op og rundt, nedbryder muskler i tyktarmen materialet, før det falder ned i tyktarmen, den sidste del af fordøjelseskanalen. Derfra bevæger den sig gennem endetarmen og ud af anus.
Bekkenet huser også reproduktive organer, som har deres egne muskler.
Penisens muskler inkluderer corpora cavernosa, to cylinderlignende kamre, der løber ned ad siderne af penis. Efter ophidselse fyldes corpora cavernosa med blod, og penis bliver fast. Dette er kendt som en erektion.
Mens penis er oprejst, forbliver et indre lag, corpus spongiosum, svampet og limt. Dette beskytter urinrøret - et rør, der fører urin og sæd ud af kroppen - mod at lukke under en erektion, så sæd kan komme ud af kroppen ved ejakulation.
Under ejakulation bevæger sæd sig fra testiklerne gennem epididymis, et langt, snoet rør på begge sider af testiklerne. Det bevæger sig derefter op til vas deferens og bag blæren. Derfra bevæger den sig til sædblæren og ud gennem urinrøret.
Prostatakirtlen er en valnød-størrelse kirtel, der styrer frigivelsen af urin fra blæren. Det udskiller også en mælkeagtig væske, der er hovedkomponenten i sæd: den del, der hjælper med at fodre og transportere sædcellerne.
Over prostata er blæren. Også kendt som urinblæren, det er en udvidelig, muskelsæk, der lagrer urin. Når det signaleres, frigiver blæren urinen i urinrøret.